Οι Υπηρεσίες του ΔΛΤΜ διαρθρώνονται όπως ακόλουθα :

1. Γραφείο Νομικών Υποθέσεων.
2. Τμήμα Διοικητικών και Οικονομικών Υπηρεσιών.
2α. Γραφείο Διοικητικών Υπηρεσιών
2β. Γραφείο Οικονομικών Υπηρεσιών
3. Τμήμα Τεχνικών Υπηρεσιών.
3α. Γραφείο Προγραμματισμού – Μελετών – Επίβλεψης Έργων
3β. Γραφείο Ηλεκτρομηχ/κών έργων και Συντήρησης Μηχ/των
3γ. Γραφείο Καθαριότητας
3δ. Γραφείο Κίνησης & Συντήρησης Οχημάτων

Σήμερα το Δημοτικό Λιμενικό Ταμείο Μυκόνου έχει στελεχωθεί με 18
συνολικά υπαλλήλους τακτικού προσωπικού στις παρακάτω ειδικότητες :

1. Π.Ε. Οικονομικού 1
2. Π.Ε. Αρχιτεκτόνων 1
3. Π.Ε. Ηλεκτρολόγων Μηχανικών 1
4. Δ.Ε. Διοικητικών Γραμματέων 1
5. Δ.Ε. Ηλεκτρολόγων 2
6. Δ.Ε. Χειριστών Η/Υ 1
7. Δ.Ε. Οδηγών 2
8. Δ.Ε. Υδραυλικών 1
9. Υ.Ε Κλητήρα Φύλακα 1
10. Υ.Ε Καθαριστών Κτιρίων 1
11. Υ.Ε Καθαριστών Εξωτερικών Κοινόχρηστων Χώρων 6
ενώ υπάρχουν 25 θέσεις Ι.Δ.Ο.Χ. διαφόρων ειδικοτήτων μη κατανομαζομένων για την αντιμετώπιση εποχιακών, περιοδικών πρόσκαιρων αναγκών του Δ.Λ.Τ.Μυκόνου

Το Δημοτικό Λιμενικό Ταμείο Μυκόνου ιδρύθηκε το 2003 σύμφωνα με τα ακόλουθα Προεδρικά Διατάγματα και Αποφάσεις του Γεν. Γραμ. Περιφέρειας :
Το Π.Δ. 28/2003 (ΦΕΚ A’ 34/2003) «Κατάργηση Λ. Τ. Κυκλάδων».
Την υπ’ αριθμ. 12011/2003 Απόφαση του Γεν. Γραμ. Περιφέρειας (ΦΕΚ Α’ 1847/2003) «Ψήφιση Οργανισμού Εσωτερικής Υπηρεσίας του Δ.Λ.Τ. Μυκόνου Ν. Κυκλάδων».
Το υπ΄αριθμ ΦΕΚ 1847Β΄/11-12-03 (τροποποιήθηκε με την υπ΄αριθμ. 4453/04 απόφαση Γ.Γ. Περιφέρειας Νοτίου Αιγαίου), στο οποίο καθορίζεται ο Οργανισμός Εσωτερικής Υπηρεσίας Δημοτικού Νομικού Προσώπου «Δημοτικού Λιμενικού Ταμείου Μυκόνου Νομού Κυκλάδων».

Στην Μύκονο λειτουργούν δυο λιμένες. Ο παλαιός λιμένας Μυκόνου στην Χώρα της νήσου και ο νέος λιμένας 3.5 km βόρεια της χώρας, στον ορμό Τούρλου. Το νέο λιμάνι Μυκόνου βρίσκεται υπό κατασκευή, ενώ δημιουργήθηκε για να καλύψει τις ολοένα ογκούμενες ανάγκες μεταφορών της νήσου και θα αποτελέσει μετά την ολοκλήρωση του μεγάλο έργο υποδομής για την Μύκονο.